Esploristoj de la Universitato de Hiroŝimo proksimiĝas al malkovro de la molekulaj procezoj malantaŭ kiel inundoj senigas plantojn je oksigeno. Ĉi tio helpos krei pli da inundo-toleremaj kultivaĵoj. Phys.org portalo.
Laŭ la Monda Banko, inundoj estas tutmonda risko, kiu minacas la vivojn kaj posedaĵojn de miliardoj da homoj. Eĉ pli da homoj riskas malsaton kiel rezulto de inundoj: akvo povas inundi kultivaĵojn. Esploristoj nun estas pli proksime al identigo molekulaj procezojsubesta kiel inundoj senigas plantojn je oksigeno. Ĉi tio helpos krei pli rezistemajn kultivaĵojn.
Kun la helpo de meta-analizo, kiu implikas re-analizi datumojn de aliaj studoj ĝenerale, teamo de la Graduate School of Integrated Life Sciences ĉe la Universitato de Hiroŝimo trovis plurajn komunajn genoj kaj rilataj mekanismoj en rizo (Oryza sativa) kaj Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). La sciencistoj publikigis siajn esplorrezultojn en la revuo vivo.
"Hipoksio estas abiotika streso por plantoj, ofte kaŭzita de inundo," diris la kunaŭtoro de la studo Keita Tamura, aludante al la manko de oksigeno kaŭzita de trosaturiĝo. “Kvankam multe da esplorado estis farita en la pasinteco, ni opiniis tion kaŝita biologiaj mekanismoj povas esti malkovrita analizante multoblajn studojn uzante meta-analizon de publike haveblaj datenoj."
La teamo temigis rizon kaj akvokreson, ĉar la genetiko de ambaŭ specioj antaŭe estis vaste studita. Laŭ Tamura, rizo ankaŭ estas konsiderita unu el la plej gravaj kultivaĵoj en la mondo, funkciante kiel la ĉefa nutraĵa produkto por pli ol kvar miliardoj da homoj, laŭ la Konsila Grupo por Internacia Agrikultura Esploro, do komprenante kiel malhelpi planton reagi al hipoksio, estas decida.
La esploristoj identigis 29 parojn da RNA-sekvencaj datumoj por Arabidopsis kaj 26 parojn por rizo en kaj normalaj kaj oksigenaj mankhavaj kondiĉoj el la disponeblaj datenoj. Laŭ profesoro Hidemasa Bono, RNA-sekvencado implikas deĉifri la genetikan skizon de subjekto ĉe antaŭfiksita punkto, kio signifas ke la datenoj povas esti uzitaj por studi kiuj genoj kaŭzis kiuj ŝanĝoj.
"Analizante RNA-sekvencajn datumojn, ni identigis 40 kaj 19 suprenreguligitajn kaj subreguligitajn genojn en ambaŭ specioj," diris Bono. "Inter ili, iuj WRKY-transkripcifaktoroj kaj cinamato-4-hidroksilazo, kies rolo en la respondo al hipoksio restas nekonata, estis ĝenerale plialtigitaj en kaj Arabidopsis kaj rizo."
Laŭ Bono, ĉi tiu ĝenerala superreguligo signifas, ke ĉi tiuj molekulaj mekanismoj iĝas pli aktivaj kiam estas manko de oksigeno, indikante sian specifan mekanisman respondecon pri kiel plantoj respondas.
Bono kaj Tamura komparis iliajn rezultojn kun simila meta-analizo de hipoksio en homaj ĉeloj kaj histoprovaĵoj. Ili trovis, ke du el la komune aktivigitaj genoj en rizo kaj Arabidopsis estis subpremita en siaj homaj ekvivalentoj.
"Nia meta-analizo sugestas malsamajn molekulajn mekanismojn por hipoksio en plantoj kaj bestoj," diris Bono. "La kandidataj genoj identigitaj en ĉi tiu studo estas atenditaj ĵeti lumon pri novaj molekulaj mekanismoj de plantrespondo al hipoksio. Finfine, ni planas manipuli unu el la kandidataj genoj per genara redakta teknologio por krei inund-toleremajn plantojn."